MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 500

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	CAC	2	6	28	33	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_018666	AGCAAG	2	12	87	98	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018666	TTC	2	6	106	111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018666	GCT	2	6	121	126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018666	TCA	2	6	161	166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018666	AAT	2	6	231	236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018666	GCT	2	6	271	276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018666	T	6	6	327	332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018666	CAAGAT	2	12	385	396	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018666	TC	3	6	399	404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018666	AT	3	6	418	423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018666	TTG	2	6	469	474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018666	GTTT	2	8	488	495	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018666	TTC	2	6	505	510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018666	AT	3	6	571	576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018666	TTC	2	6	635	640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018666	TCATT	2	10	654	663	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018666	T	6	6	682	687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018666	TTC	2	6	725	730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018666	TAT	2	6	1879	1884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018666	ATA	2	6	1888	1893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018666	AT	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018666	T	6	6	1951	1956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018666	TAT	2	6	1974	1979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018666	CCT	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018666	AGG	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018666	GGC	2	6	2000	2005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018666	ATT	2	6	2037	2042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018666	TA	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018666	AG	3	6	2081	2086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018666	A	7	7	2097	2103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018666	GGT	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018666	GTAT	2	8	2247	2254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018666	G	6	6	2281	2286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018666	TGTC	2	8	2287	2294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018666	TAT	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018666	CAA	2	6	2323	2328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018666	GTT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018666	ATA	2	6	2441	2446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018666	TCTAGC	2	12	2447	2458	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018666	TGAT	2	8	2518	2525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018666	ACC	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018666	ATC	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018666	ATA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018666	GGA	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018666	TCG	2	6	2735	2740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018666	CCAC	2	8	2755	2762	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_018666	TG	3	6	2919	2924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018666	ATAC	2	8	2935	2942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018666	ATG	2	6	3081	3086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018666	GAGTA	2	10	3119	3128	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018666	CTC	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_018666	ACT	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018666	GCCA	2	8	4842	4849	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018666	CCTG	2	8	4905	4912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018666	GAG	2	6	4927	4932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018666	CTTG	2	8	4955	4962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018666	GCT	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018666	CGAC	2	8	5043	5050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018666	TCC	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_018666	GTG	2	6	5107	5112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018666	TTC	2	6	5151	5156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018666	ATC	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018666	TTG	2	6	5296	5301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018666	CAGA	2	8	5335	5342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018666	GCCC	2	8	5367	5374	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_018666	GTAA	2	8	5392	5399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018666	CCAC	2	8	5406	5413	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_018666	AAC	2	6	5582	5587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018666	TCTT	2	8	5648	5655	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018666	TGC	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018666	GAT	2	6	5697	5702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018666	CAG	2	6	5794	5799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018666	ATT	2	6	6231	6236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018666	TTC	2	6	6254	6259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018666	GC	3	6	6330	6335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018666	TAT	2	6	6344	6349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018666	GCC	2	6	6359	6364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018666	GGC	2	6	6394	6399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018666	TGT	3	9	6469	6477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018666	CAG	2	6	6498	6503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018666	GAT	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018666	ATAA	2	8	6694	6701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018666	TAA	2	6	6757	6762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018666	T	6	6	6845	6850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018666	ATT	2	6	7679	7684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018666	TGAT	2	8	8171	8178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018666	TGA	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018666	A	6	6	8258	8263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018666	TCA	2	6	8303	8308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018666	TCA	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018666	ACT	2	6	8364	8369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018666	GCCA	2	8	8388	8395	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018666	GCA	2	6	9326	9331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018666	ATG	2	6	9412	9417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018666	TCT	2	6	9419	9424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018666	GAAA	2	8	9429	9436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018666	CTA	2	6	9443	9448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018666	TTC	2	6	9474	9479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018666	TCATT	2	10	9493	9502	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018666	T	6	6	9521	9526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018666	TTC	2	6	9564	9569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018666	GCAT	2	8	10913	10920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018666	TTA	2	6	10929	10934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018666	ATA	2	6	10958	10963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018666	ATA	2	6	11037	11042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018666	ATG	2	6	11058	11063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018666	TTGA	2	8	11155	11162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018666	ATGGT	2	10	11191	11200	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018666	CAA	2	6	11350	11355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018666	CAT	2	6	11382	11387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018666	TCC	2	6	11680	11685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018666	TTA	2	6	12963	12968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018666	TA	3	6	12982	12987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018666	A	6	6	13007	13012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018666	CAAAA	2	10	13043	13052	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018666	A	8	8	13049	13056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018666	ATT	2	6	13065	13070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018666	CTG	2	6	13146	13151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018666	GTG	2	6	13166	13171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018666	TGC	2	6	13239	13244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018666	CCG	2	6	13294	13299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018666	GAG	2	6	13389	13394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018666	ATT	2	6	13901	13906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018666	GTA	2	6	13965	13970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018666	GCA	2	6	14885	14890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018666	CAG	2	6	15055	15060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018666	CTC	2	6	15072	15077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_018666	CCGAA	2	10	15084	15093	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_018666	CAGCC	2	10	15162	15171	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_018666	ATC	2	6	15172	15177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018666	CAGC	2	8	15272	15279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018666	CAG	2	6	15293	15298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018666	CCG	2	6	15337	15342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_018666	TCC	2	6	15399	15404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018666	CGG	2	6	15447	15452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018666	GGC	2	6	15467	15472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018666	GGAT	2	8	15564	15571	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018666	CCG	2	6	15604	15609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_018666	GTC	2	6	15635	15640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018666	TCA	2	6	15711	15716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018666	GTCA	2	8	15731	15738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018666	CAG	2	6	15773	15778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018666	GCA	2	6	15782	15787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018666	CAG	2	6	15806	15811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018666	GCCG	2	8	15835	15842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018666	CAG	2	6	15905	15910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_018666	AGGTGC	2	12	15947	15958	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_018666	CGG	2	6	16048	16053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_018666	CCG	2	6	16080	16085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_018666	GCA	2	6	16094	16099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_018666	CT	3	6	16224	16229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018666	CGG	2	6	16269	16274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_018666	CGG	2	6	16308	16313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018666	CAG	2	6	16418	16423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_018666	GTC	2	6	16430	16435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_018666	AGA	2	6	16436	16441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018666	TGG	2	6	17257	17262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018666	AAAT	2	8	17355	17362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018666	CAG	2	6	17405	17410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_018666	GGC	2	6	17424	17429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_018666	CAAT	2	8	17993	18000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_018666	TATTGA	2	12	18536	18547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018666	A	6	6	18559	18564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018666	ATT	2	6	18579	18584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018666	TAT	2	6	18585	18590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018666	TAAT	2	8	18594	18601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_018666	ATAA	2	8	18615	18622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_018666	CCT	2	6	21466	21471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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171	NC_018666	TAA	2	6	21513	21518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018666	ATGT	2	8	21536	21543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018666	TAT	2	6	21582	21587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_018666	GAT	2	6	21592	21597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018666	AT	3	6	21604	21609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_018666	TTG	2	6	22350	22355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_018666	TTC	2	6	22362	22367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_018666	ACTTGA	14	84	22385	22468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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180	NC_018666	CA	3	6	22805	22810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
181	NC_018666	AAT	2	6	22861	22866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018666	CCT	2	6	22910	22915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_018666	CGT	2	6	22996	23001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_018666	GTG	3	9	23050	23058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018666	GCTG	2	8	23083	23090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
186	NC_018666	AGA	2	6	23162	23167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_018666	TAAT	2	8	23213	23220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_018666	GCG	2	6	23843	23848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_018666	ACC	2	6	23894	23899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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192	NC_018666	A	8	8	27044	27051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_018666	TGTA	2	8	27094	27101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
194	NC_018666	AGGAA	2	10	27247	27256	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
195	NC_018666	GAA	2	6	27319	27324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
196	NC_018666	AC	3	6	27346	27351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
197	NC_018666	TGTT	2	8	27703	27710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
198	NC_018666	T	6	6	28503	28508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_018666	TGG	2	6	35089	35094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_018666	AAAT	2	8	39820	39827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018666	CA	3	6	39862	39867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
291	NC_018666	AAC	2	6	39871	39876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_018666	A	6	6	39928	39933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_018666	GTCTG	2	10	40293	40302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
295	NC_018666	TCC	2	6	40305	40310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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421	NC_018666	TAA	2	6	69977	69982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_018666	AT	3	6	69990	69995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_018666	ATA	2	6	70961	70966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_018666	TGA	2	6	71089	71094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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